L'Unité de Recherche Amélioration, Génétique et Physiologie Forestières (UR0588) rassemble des compétences en génétique (quantitative et des populations), génomique et physiologie appliquées à une même classe d’objets : les arbres forestiers.

Dans le domaine de l’amélioration et de la génétique, l'unité AGPF contribue à l'innovation variétale forestière pour le reboisement à basse et moyenne altitude en vue d'une production de bois d'œuvre. Elle conduit des programmes d’amélioration génétique sur 6 espèces utilisées pour le reboisement en France : trois espèces ou genres résineux (douglas, mélèze et pin sylvestre) et trois espèces ou genres feuillus (frêne, merisier et peuplier). De plus, elle développe une étude sur les interactions entre variétés améliorées et populations naturelles d’arbres forestiers.

Dans le domaine de la physiologie du développement, les travaux menés à l’unité AGPF visent, d’une part, à optimiser l'embryogenèse somatique des gymnospermes comme moyen de diffusion de certains génotypes élites et d’autre part à élucider les mécanismes impliqués dans la formation du bois et dans la définition de ses propriétés essentielles.

Le projet de l’unité a pour principaux objectifs la valorisation raisonnée des ressources génétiques forestières et l’évaluation de l’impact écologique des populations domestiquées sur l'écosystème forestier. Ce projet s'appuie sur trois lignes de force :
 

• Maintenir un effort de création variétale sur quelques espèces importantes pour les reboisements
• Approfondir nos connaissances sur les processus responsables de la formation du bois
• Centrer les études de génomique sur le Peuplier.

Les travaux de recherche de l’unité sont structurés en 4 thématiques:

• Méthodologie de la sélection et création variétale (Equipe Génétique)
• Interaction des innovations variétales avec l'écosystème forestier (Equipe Génétique)
• Formation des parois lignifiées du bois (Equipe Xylème)
• Embryogenèse somatique chez les conifères (Equipe Méristème).

Les travaux de recherche sont réalisés dans plusieurs laboratoires : biochimie, histologie, biologie moléculaire, culture in vitro, bioinformatique.

Les analyses sur le bois sont menées sur le plateau technique Génobois. Les activités en serre, en pépinière et en forêt sont réalisées en forte association avec l’Unité Expérimentale  GBFOR.

L’UR AGPF est constituée de trois équipes de recherche, tandis que ses effectifs sont de 38 personnes permanentes dont 23 chercheurs et ingénieurs.
L'unité encadre (ou co-encadre) en moyenne 4 doctorants et accueille 1 à 2 étudiants de DEA par an.

Le Conservatoire Génétique des Arbres Forestiers de l'Office National des Forêts est associé à l’UR AGPF par un statut d'unité sous contrat Conservatoire génétique des Arbres Forestiers (USC 2025, CGAF).
Il en va de même avec le laboratoire LBLGC à l’Université d’Orléans (USC 2030, Arbres et Réponses aux Contraintes Hydriques et Environnementales (ARCHE).  
L'UAGPF entretient des collaborations avec divers partenaires de la filière graines/forêt/bois (FCBA; CEMAGREF; CIRAD; CNRS; GIE "Semences Forestières Améliorées"; IDF; ONF).

Ces collaborations s'opèrent notamment dans le cadre de GIS tels que le GIS Variétés Forestières Améliorées et le GIS Amélioration génétique du Peuplier.